Geboren 1891 in Basel, Vater Seidenfabrikant Benedict Stahelin. Studium der Medizin und insbesondere Psychiatrie in Basel und München. Dissertation 1918 beim Psychiater Gustav Wolff, anschliessend Assistent und im Burghölzli-Spital in Zürich. 1926 Habilitation zum Psychiater an der Universität Zürich, 1927 Erster Oberarzt und Leiter der Pschiatrischen Universitätspolyklinik. 1929 Berufung nach Basel als ordentlicher Professor für Pschiatrie und Direktor der kantonalen Heil- und Pflegeanstalt Friedmatt. 1935 und 1936 Dekan der Medizinischen Fakultät, 1948 Rektor, 1959 Emeritierung. Stahelin starb 1969 nach langer Krankheit. 

Quellen: 

Bonjour, Edgar: Die Universität Basel von den Anfängen bis zur Gegenwart 1460-1960. Basel 1960.

Thurneisen, Eduard: Zur Erinnerung an Prof. Dr. med. John E. Staehelin-Iselin. Manuskript zur Rede an der Trauerfeier am 20. Mai 1969 in der Martinskirche Basel.